Tout comme dans Xenosaga I, on retrouve des Segment adresses dans Xenosaga II. Ces Segment adresses sont des portes secrètes que l’on ne peut ouvrir que grâce à des decoder correspondant aux numéros des portes.

Segment adress 1
Localisation : Se situe à Dammerung, au début du CD2 lorsque vous prenez seul le contrôle de Shion.
Decoder : Il vous faudra compléter la CS Campagne no5.
Récompense : Secret Key 8.


Segment adress 2
Localisation : Se situe dans l’Elsa.
Decoder : Ormus Stronghold.
Récompense : Secret Key 22.


Segment adress 3
Localisation : Dans Second Miltia, dans l’agence de publicité.
Decoder : Segment adress 16, vous devez posséder Music Score.
Récompense : Robot Part Left Leg

.
Segment adress 4
Localisation : Ormus Stronghold.
Decoder : Subconscious domain (summer).
Récompense : Secret Key 9.


Segment adress 5
Localisation : Labyrinthos.
Decoder : Labyrinthos.
Récompense : Secret Key 20.


Segment adress 6
Localisation : Second Miltia, près de l’agence de publicité.
Decoder : Second Miltia, à côté du segment adress 6, parlez à Angelina pour le recevoir.
Récompense : Secret Key 3.


Segment adress 7
Localisation : Dammerung.
Decoder : Vous la récupererez dans la segment adress no14.
Récompense : Robot Part Left Arm.


Segment adress 8
Localisation : Desert.
Decoder : Terminez la GS Campagne no13.
Récompense : Robot Part Torso.


Segment adress 9
Localisation : Second Miltia, dans la maison des Uzuki.
Decoder : dans le donjon Submerged City.
Récompense : Secret Key 4.


Segment adress 10
Localisation : Submerged City.
Decoder : Omega System (possible seulement après avoir fini le jeu).
Récompense : Secret Key 26.


Segment adress 11
Localisation : Kukai Fondation.
Decoder : Terminez d’abord la GS Campagne no18, Janet vous donnera alors un code puis entrez le code qu’elle vous donne dans la statue dans la partie ouest de la ville. Allez ensuite voir la Realian dans le Park Area et répondez lui avec la première option pour recevoir le decoder 11.
Récompense : Secret Key 23.


Segment adress 12
Localisation : Heaven’s ruins.
Decoder : Heaven’s ruins.
Récompense : Sequencer D.


Segment adress 13
Localisation : Ormus Stronghold.
Decoder : Terminez la GS Campagne 35.
Récompense : Robot Part Head.


Segment adress 14
Localisation : Old Miltia.
Decoder : Terminez la GS Campagne 27.
Récompense : Robot Part Right Arm, Decoder 07
.

Segment adress 15
Localisation : Subconscious Domain (Winter).
Decoder : Dammerung.
Récompense : Secret key 5.


Segment adress 16
Localisation : Kukai Fondation, il faut finir la GS Campagne 16 et jouez au piano pour libérer le segment adress 16.
Decoder : Terminez les GS Campagne 29.
Récompense : Robot Part Right Leg, Decoder 03
.

Segment adress 17
Localisation : Omega System.
Decoder : GS Campagne 6.
Récompense : Secret key 28.


Segment adress 18
Localisation : Submerged City.
Decoder : Dammerung.
Récompense : Secret key 16.