Rogue Galaxy vous place dans la peau d’un jeune homme de 17 ans appelé Jaster Rogue. Recueilli, alors qu’il n’était qu’un bébé, sur la planète Rosa par un père du nom de Raul, Jaster a toujours rêvé de découvrir la galaxie. Son rêve deviendra rapidement réalité le jour où sa planète sera attaquée par des monstres. Jaster décida alors de combattre ces monstres, il sera aidé par un personnage inconnu qui lui donnera par la même occasion une arme légendaire.



Dans le même moment, deux envoyés du capitaine Dorgengoa se trouvent également sur la planète Rosa à la recherche d’un dénommé « Desert Claw ». Remarquant que Jaster possède l’arme mythique, ils croient avoir trouver le légendaire Desert Claw et décident de l’emmener avec eux comme le demandait le capitaine Dorgengoa. C’est ainsi de cette façon que notre jeune héros va partir à l’exploration de la galaxie.

Notre petit groupe va peu à peu s’agrandir et se retrouver confronter à une force ennemie représentée par une grande entreprise appelée Daytron. Ses intentions sont encore inconnues mais elles ne paraissent pas nettes du tout. A sa tête se situe un personnage peu recommandable appelé Valkog très assoiffé de pouvoir. Celui-ci souhaite gouverner la galaxie et instaurer une dictature en sa faveur. L’objectif de Dorgengoa et de son équipage apparaît encore mystérieux mais va se retrouver rapidement confronter à celui de Valkog…